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Journées « Conduire et construire un plan de gestion des données : De la base de données à la pérennisation »

par Chloé MARTIN, PRESSAC Jean-Baptiste - publié le , mis à jour le

Documents des intervenants des journées « Conduire et construire un plan de gestion des données : De la base de données à la pérennisation » qui s’est déroulée du 20 au 22 octobre 2015 à Sète.

Télécharger le programme des journées (PDF)

Pour réaliser les travaux pratiques (TP) vous aurez besoin de la version 5.0 du logiciel Virtual Box et de la machine virtuelle Lubuntu Linux (Le lien expire le 10/11/2015) mise en place pour l’occasion (4,9 Go). Vous trouverez les paramètres de connexion dans le fichier Paramètres de connexion à la machine virtuelle (TXT).

Si vous êtes sous Windows et que le message d’erreur suivant s’affiche au démarrage de la machine virtuelle, vous aurez besoin d’activer la virtualisation matérielle VTx dans le BIOS de votre PC : La virtualisation matérielle VT-x/AMD-V n’est pas disponible sur votre système. L’invité 64 bits ne détectera pas un processeur 64 bits et ne pourra pas démarrer.

Sur un PC de marque HP, il faut appuyer sur la touche F10 au démarrage de l’ordinateur pour rentrer dans le BIOS. La virtualisation matérielle s’active ensuite dans "System configuration" puis en cochant "Virtualization technology (VTx)". Sauvegardez les modifications, puis quittez le BIOS.

Pour les utilisateurs avancés utilisant Linux et ne souhaitant pas installer une machine virtuelle, vous pouvez configurer votre environnement de travail en suivant cette procédure (PDF).

Mardi 20 octobre 2015

Plan de gestion des données : formulaire administratif ou outil de travail ?
Télécharger la présentation (PDF)
- Intervenantes : Françoise Cosserat (Inist-CNRS [1]) et Marie-Christine Jacquemot-Perbal (Inist-CNRS)

CeSGO Data Management Plan in the real Life ... Sciences
Télécharger la présentation sur le site du CeSGO
- Intervenant : Yvan Le Bras (CeSGO)

En soirée : Lightning talks

OpenRefine : un couteau suisse pour manipuler les données
Télécharger la présentation (PDF)
- Intervenant : Stefan Gaget (UMR 8199 - Génomique Intégrative et Modélisation des Maladies Métaboliques)

HeidiSQL
Télécharger la présentation (PDF)
- Intervenant : Stefan Gaget (UMR 8199 - Génomique Intégrative et Modélisation des Maladies Métaboliques)

Carnet de terrain électronique, Retour d’expérience sur la création d’une boite à outils
Télécharger la présentation (PDF)
Visionner la présentation de Marie-Claude lors des 15èmes Rencontres Mondiales du Logiciel Libre en juillet 2014 (Vidéo)
- Intervenant : Marie-Claude Quidoz (UMR 5175 - Centre d’Écologie Fonctionnelle et Évolutive)

Data papers : Une incitation à la publication de données sur la biodiversité
Télécharger la présentation (PDF)
- Intervenant : Sophie Pamerlon (Système mondial d’information sur la biodiversité - Global Biodiversity Information Facility)

Portail ECOSCOPE : Architecture et interopérabilité
mots clés : Ecological Metadata Language (EML), INSPIRE, EnvThes, AGROVOC, GEMET

Télécharger la présentation (PDF)
- Intervenant : Cédric Chavériat (Fondation pour la Recherche sur la Biodiversité)

Mercredi 21 octobre 2015

Atelier 1

Atelier « Décrire sa base de données à l’aide de modèles conceptuels »
mots clés : Merise, Entité-Association, UML, 2TUP, Modèle Conceptuel de Données (MCD), Modèle Logique Relationnel (MLR), PostgreSQL
Télécharger la présentation (Première partie) (PDF)
Télécharger la présentation (Deuxième partie) (PDF)
- Intervenants : Marie-Claude Quidoz (UMR 5175 - Centre d’Écologie Fonctionnelle et Évolutive), Guillaume Harry (Direction des systèmes d’informations du CNRS)

Présentation du logiciel de modélisation OpenModelSphere
mots clés : Merise, Entité-Association, UML, Modèle Conceptuel de Données (MCD), Modèle Logique Relationnel (MLR), PostgreSQL
Télécharger la présentation (PDF)
- Intervenants : Marie-Claude Quidoz (UMR 5175 - Centre d’Écologie Fonctionnelle et Évolutive), Guillaume Harry (Direction des systèmes d’informations du CNRS)

Atelier 2

Rendre nos Données Accessibles et Interopérables sur le Web
mots clés : SPARQL, web sémantique, RDF, SKOS, OWL
Télécharger la présentation (PDF)
- Intervenant : Franck Michel (I3S - UMR 7271, CNRS - Univ. Nice Sophia)

Atelier « Mise en place d’un SPARQL EndPoint. Servir du RDF via HTTP avec Jena et Fuseki »
Télécharger la présentation (lien vers la présentation)
- Intervenant : Wilfried Heintz (Unité Mixte de Recherche « Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers)

Création d’un thésaurus collaboratif, cas d’un groupe CESAB [2]
Télécharger la présentation (PDF)
- Intervenant : Baptiste Laporte (Centre de synthèse et d’analyse sur la biodiversité / Fondation pour la Recherche sur la Biodiversité)

Atelier 3

Interfacer avec la base de données, Des solutions permettant de répondre aux besoins simples
mots clés : CSV, XLS, TXT, R, SQL, phpMyAdmin, HeidiSQL
Télécharger la présentation (PDF)
- Intervenant : Stefan Gaget (UMR 8199 - Génomique Intégrative et Modélisation des Maladies Métaboliques)

Découvrir Talend, Un TP pour manipuler les briques de base
mots clés : Interface, PostgreSQL, Excel, importation
Télécharger la présentation de Talend Open Studio (PDF)
Télécharger le TP (PDF)
- Intervenant : Éric Quinton (Institut national de recherche en sciences et technologies pour l’environnement et l’agriculture)

Atelier 4

Atelier « NoSQL faut-il franchir le pas ? »
mots clés : NoSQL, modèle relationnel, théorème CAP
Télécharger la présentation (PDF)
Télécharger le TP (PDF)
- Intervenant : Guillaume Harry (Direction des systèmes d’informations du CNRS)

En soirée

Les métiers des bases de données
mots clés : veille métier, branche d’activité professionnelle (BAP),
Télécharger la présentation (PDF)
- Intervenant : Muriel Perier (Observatoire des Métiers et de l’Emploi Scientifique du CNRS)

Jeudi 22 octobre 2015

Identifiants des documents numériques : ISBN, ISSN, URL, Handle, DOI, OpenURL, OAI, ARK
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- Intervenant : Jean-Luc Archimbaud (Mathdoc)

Le GBIF [3] et les identifiants persistants : Application des DOI aux jeux de données
mots clés : Integrated Publishing Toolkit (IPT), identifiant pérenne, PURL, URI, UUID, GUID, DOI, Darwin Core, GBIF
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- Intervenant : Sophie Pamerlon (Système mondial d’information sur la biodiversité - Global Biodiversity Information Facility)

DataCite identifier vos données enregistrer et exposer vos métadonnées
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- Intervenant : Mohamed S. Yahia (Inist-CNRS [1])